Silenciamiento epigenético de genes asociados a cáncer conservados a través de millones de años de evolución

He estado ocupada las últimas semanas y por eso no había escrito nada nuevo, pero acabo de toparme con un artículo muy interesante de una de las áreas en Biología que encuentro muy interesante y en la que me gustaría desarrollarme: ¡la Epigenética! y bueno ¿qué es eso? sencillamente son cambios químicos que se dan en el ADN sin modificar su secuencia génica y éstos cambios son heredables, aún así pensaríamos que entonces no tienen nada efectos en la función de un gen, ¿pero que creen? ¡pues sí! están involucradas en la regulación de los genes, la más estudiada es la metilación de ADN y bueno a continuación escribo en un breve párrafo por qué es tan importante esta marca.

La metilación del ADN es un regulador muy importante en la transcripción de los genes. Un cuerpo muy grande de evidencias ha demostrado que la metilación aberrante del ADN está asociada con el silenciamiento no programado de los genes y los genes que tienen niveles muy altos de 5-metilcitosina en su región promotora son transcripcionalmente silenciados. La metilación del ADN es esencial en el desarrollo embrionario, y en las células somáticas, los patrones de metilación del ADN son, en general, transmitidos a las células hijas con gran fidelidad. Los patrones aberrantes de metilación del ADN han sido asociados con un gran número de enfermedades del ser humano y se han encontrado de dos maneras distintas: hipermetilación e hipometilación, comparado con los estándares normales. La hipermetilación es una de las mayores modificaciones epigenéticas responsable de reprimir la transcripción vía región promotora de los genes supresores de tumores. La hipermetilación ocurre en las islas CpG de la región promotora y está asociada con la inactivación del gen. La hipometilación también ha sido implicada en el desarrollo y progresión del cáncer a través de diferentes mecanismos. Generalmente, en procesos tumorales, se observa una hipometilacion del ADN, exceptuando regiones promotoras específicas que se encuentran hipermetiladas que normalmente corresponden a promotores de genes supresores de tumores. Esto conduce a una expresión génica aberrante.

Y, esa solo es una breve intro del área: a continuación les dejo una breve descripción del artículo que me encontré:

Silenciamiento epigenético de genes asociados a cáncer conservados a través de millones de años de evolución

Los estudios en pez cebra realizados por un equipo dirigido por el Instituto Garvan de Investigación Médica sugieren que una modificación epigenética que desactiva algunos genes asociados con el cáncer se ha conservado durante más de 400 millones de años. Los científicos descubrieron cómo los genes que se activan en algunos cánceres humanos también existen en el pez cebra, pero se desactivan a las pocas horas de la fertilización. Su estudio, publicado en Nature Communications, proporciona nuevas perspectivas sobre cómo la regulación epigenética de los genes, incluidos aquellos que están asociados con el desarrollo del cáncer en la vida posterior, puede persistir en grandes distancias evolutivas. Los hallazgos también resaltan diferencias clave en cómo el epigenoma se restablece durante la embriogénesis humana y del pez cebra, lo que podría ayudar a dirigir la investigación en curso sobre la herencia epigenética.

Noticia en inglés: https://www.genengnews.com/news/epigenetic-silencing-of-cancer-genes-conserved-through-millions-of-years-of-evolution/

Artículo original:

https://www.nature.com/articles/s41467-019-10895-6?_ga=2.13321079.1965997820.1563047002-1297114922.1563047001

Pie diabético: “Podemos reducir las amputaciones con prevención”

Leyendo un poco sobre el pie diabético y grados que tiene, veo que hay muchos casos que se pueden prevenir solo controlando niveles de glucemia y siguiendo recomendaciones generales como tener limpieza, cortar uñas de forma adecuada, etc., pero a pesar de eso la mayoría de los pacientes no lo hacen porque no están bien informados, los médicos solo se enfocan en dar tratamientos pero no recomendaciones de cómo prevenir un pie diabético que puede llevar a una amputación y que es una de los estados que generan más gastos a los gobiernos y sistemas de salud, la única manera es PREVENIR.

Origen: Pie diabético: “Podemos reducir las amputaciones con prevención”

Resultado de imagen para pie diabetico grados

Les dejo varios artículos que leí sobre un tipo de ampolla llamado Bullosis diabeticorum bastante interesante en la cuál dice que los pacientes no necesitan un tratamiento específico, se puede controlar reduciendo sus niveles de glucemia y usualmente sana sin dejar cicatrización en varias semanas. Me pareció muy interesante esto, porque en los casos que he visto en familiares o conocidos, la mayoría de las veces los médicos recurren a hacer cirugías y eso contrasta con lo que leo en varios artículos y presentaciones en internet, sería bueno que los pacientes se informarán primero si es buena opción una cirugía, ya que imagino depende de cada caso.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5776741/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2802364/

“Getting to know yourself is essential for job seeking in the industry”

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Name: Alessandro Sorrentino
Did PhD at: Università degli Studi di Salerno
Current position: EU Medical Director at Sanofi Genzyme
Interviewed by: Christine Zimmer

After his PhD, Alessandro Sorrentino was in love with Science and finished his post doc with a Nature paper. He had never planned to leave academia. Why should he? After all, his post doc went very well.

Experience:
PhD from Università degli Studi di Salerno 2001-2005,
Post doc at Ludwig Institute for Cancer research 2005-2008,
Clinical Scientist Nordic Europe at Centocor via DOCS international 2009-2010,
edical Advisor Immunology Nordic Europe 2010-2011,
EMEA Medical Advisor Immunology 2012-2015,
Director Medical Affairs 2015-2017 at The Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson
Current position: EU Medical Director at Sanofi Genzyme 2017-present

In the end of his postdoc, Alessandro started to think about the future and realized that constantly applying for funding was not something he wanted to spend the majority of his time with…

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An enzymatic pathway in the human gut microbiome that converts A to universal O type blood/ Una ruta enzimática en el microbioma del intestino humano convierte el tipo de sangre A al O

I’ve recently seen a very nice publication in which a metagenomic screening was performed in the human gut microbiome for enzymes that could be able to remove the sugar antigens in the blood cell types A/B. The major finding was that it was possible to convert the A+ red blood cells to O type ending with the conversion of a whole unit of blood, this has major implications in the blood supply and potential applications in organ transplantation; however, as almost everything else in Biology, further research is needed, below I’ll leave the abstracts in English/Spanish.

Recientemente, he visto una publicación muy interesante en la que se realizó un análisis metagenómico en el microbioma intestinal humano para detectar enzimas que podrían eliminar los antígenos del azúcar en los tipos de células sanguíneas A / B. El principal hallazgo fue que se pudieron convertir glóbulos rojos A + a tipo O, que terminó con la conversión de una unidad completa de sangre, lo cual tiene importantes implicaciones en el suministro de sangre y posibles aplicaciones en el trasplante de órganos; sin embargo, como casi todo lo demás en Biología, es necesario realizar una investigación más detallada. A continuación, dejaré los resúmenes en inglés / español.

Abstract

Access to efficient enzymes that can convert A and B type red blood cells to ‘universal’ donor O would greatly increase the supply of blood for transfusions. Here we report the functional metagenomic screening of the human gut microbiome for enzymes that can remove the cognate A and B type sugar antigens. Among the genes encoded in our library of 19,500 expressed fosmids bearing gut bacterial DNA, we identify an enzyme pair from the obligate anaerobe Flavonifractor plautii that work in concert to efficiently convert the A antigen to the H antigen of O type blood, via a galactosamine intermediate. The X-ray structure of the N-acetylgalactosamine deacetylase reveals the active site and mechanism of the founding member of an esterase family. The galactosaminidase expands activities within the CAZy family GH36. Their ability to completely convert A to O of the same rhesus type at very low enzyme concentrations in whole blood will simplify their incorporation into blood transfusion practice, broadening blood supply.

Resumen

El acceso a enzimas eficientes que pueden convertir los glóbulos rojos de tipo A y B en donantes «universales» O aumentaría enormemente la cantidad de sangre para transfusiones. Aquí se presenta el análisis metagenómico funcional del microbioma intestinal humano para las enzimas que pueden eliminar los antígenos de azúcar de tipo A y B. Entre los genes codificados en la biblioteca de 19,500 fósmidos expresados ​​que contienen ADN bacteriano intestinal, se identificaron un par de enzimas del anaerobio obligado Flavonifractor plautii que trabaja en concierto para convertir eficientemente el antígeno A al antígeno H de la sangre de tipo O, a través de un intermedio de galactosamina . La estructura de rayos X de la N-acetilgalactosamina desacetilasa revela el sitio activo y el mecanismo del miembro fundador de una familia de esterasas. La galactosaminidasa expande las actividades dentro de la familia GH36 de CAZy. Su capacidad para convertir por completo A a O del mismo tipo de rhesus a concentraciones muy bajas de enzimas en sangre total simplificará su incorporación a la práctica de transfusión de sangre, ampliando el suministro de sangre.

https://www.nature.com/articles/s41564-019-0469-7.epdf?shared_access_token=jnyuR4JFwK68PoiVi8nja9RgN0jAjWel9jnR3ZoTv0MpB-7My91cuhMMV54vmypBlLNAGYjzSH3mbd7oZSCq45qE0yyby1B6awJDaUXp5Fnvd3PElTcVnqAlwUGJPrIdUT1QPFPEwhuSAEUIhCCVgg%3D%3D

Y bueno, ya oficialmente concluí mi maestría luego de varios años

Bueno, que les cuento que hace como una semana recibí mi título de la Universidad de Lyon I, un sueño cumplido para mí, ya que siempre había querido ir a Francia y estudiar ahí, que hasta aprendí Francés y lo certifiqué, llegué hasta nivel B2, tomé un curso de C1 que completé con buena nota (un 15 en escala francesa/belga que en México es algo así como 90)! pero no tengo certificado oficial de ese nivel :(, así que probablemente lo haga el próximo año (o no sé) para que les miento, ya se me anda hasta olvidando xD

Anteriormente, me había llegado mi título de la Universidad de Ámberes, ubicada en Bélgica y como el máster era Erasmus Mundus pues a ver sí se nos hace que las unis de Barcelona también nos den el último título, aquí se los dejo, dejen sus comentarios o dudas abajo 🙂

Sometimes more is more: raising mitochondrial DNA copy number could treat disease

So, here is a very interesting paper I found today!

Avatar de Isabel Juliana HofmanKarolinska Institutet Career Blog

Mitochondria are the power plants of our cells and are descendants of cooperating bacteria. A study in mice shows that increasing the copies of mitochondria’s own DNA could be used as therapy for certain human diseases.

Isabel Hofman

Mitochondria are the power plants of eukaryotic cells, as the mitochondrial respiratory electron transport chain serves as the main cellular energy source. These organelles are generally accepted to be descendants of primitive bacteria that started to cooperate with single-celled organisms that became our primordial ancestors (BOX 1). As a relic of these ancient times, mitochondria still carry their own genetic material1.

BOX 1: Evolution of mitochondria
The exact identities of both the ancestral mitochondrion, and the cell that engulfed it to become the ancestor of all eukaryotes, are unclear. Several theories speculate on the conformation of the ancient tandem as the metabolic nature of the pre-mitochondrion and the evolutionary stage…

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¿Por qué hacer un blog?

Desde hace tiempo yo tenía intención de compartir fotos de mis viajes, mis estudios, hechos de ciencia/tecnologías, mis cosas personales, etc., pero sólo se me ocurría hacerlo a través de videos en YouTube, considero que no soy muy buena hablando en público y no me gusta el tono de mi voz, entonces nunca subí videos, a parte que no me queda mucho tiempo libre.

Hasta hace poco, no sabía como crear blogs :O a pesar que es fácil! y bueno tuve que aprender como parte de una actividad de un curso que tomé en línea que duró aproximadamente 6 semanas -.- más adelante les platicaré sobre qué era el curso.

Siento que tengo la necesidad de compartir las cosas que sé, aprendo o leo, que no mucho sirve que solo queden en mi cabeza, sé que a mucha gente no le importa pero a otros sí y por eso quise crear este blog 🙂